Francesca Allegri dirige insieme a Massimo Tosi l’Associazione Millenaria di Certaldo. Fra le sue pubblicazioni ricordiamo: (con R. Galgani) Storia di Certaldo dalle origini al 1799, tratta da un manoscritto di autore anonimo (1991); (con Massimo Tosi) Certaldo: poesie del Medioevo. Alla scoperta delle chiese, delle torri, dei palazzi, nel paese di Giovanni Boccaccio (2002); (con Massimo Tosi) Castelfiorentino: terra d’arte, centro viario e spirituale sulla Francigena (2005); (con Massimo Tosi) Storie, misteri e leggende lungo la via Francigena (2008); (con Massimo Tosi) Storie, misteri e leggende lungo la via Francigena del sud (2011).